应用微阵列芯片分析结肠癌组织中miRNA差异性表达

• 作者: 于永扬 周总光 周斌 杨烈 王存 马钦
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠癌 miRNA 微阵列芯片
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 344-348
• 分类号: R735.35
• 语种: 中文

摘要

目的 分析结肠癌与正常结肠黏膜的微小RNA(miRNA)表达谱差异.方法 收集结肠癌组织和癌旁正常结肠黏膜共12对,抽提、纯化RNA,加入荧光标记后与miRNA寡核甘酸基因芯片(Affymetrix公司)杂交,应用SAM软件进行数据分析,对有显著差异的miRNA进行实时荧光定量PCR验证,采用靶基因分析软件分析miRNA功能.结果 has-miR-182、has-miR-17、has-miR-106a、has-miR-93、has-miR-200c、has-miR-92a、has-let-7a、has-miR-20a等8个miRNA在肿瘤组织中显著上调[中位假基因验出率(FDR)＜5%],has-miR-195、has-miR-143、has-miR-145等3个miRNA显著下调(FDR＜5%).结论 结肠癌与正常结肠黏膜之间存在明显的miRNA差异表达,这些miRNA的差异性表达可能与结肠癌的发病、侵袭、转移相关.