陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析

• 作者: 刘方 华金平 尚明照 王坤波
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 陆地棉 密码子偏性 GC含量 最优密码子
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 245-253
• 分类号: Q755
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.02.003

摘要

[目的]通过分析陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响密码子偏性形成的主要因素.[方法]以陆地棉叶绿体基因组为研究对象,利用Mobyle及其它软件,分析叶绿体50个基因密码子的使用模式.[结果]陆地棉叶绿体基因组密码子GCI与GC2之间的相关系数达到极显著水平,GC3含量最低,与GCl2的相关系数为0.14,双尾检验未达到显著水平;单个基因ENC比值多分布在-0.05-0.05;对应性分析,第一轴上显示了1 0.27%的差异,与GC3、ENC的相关系数分别为0.223和-0.147,均未达到显著水平.[结论]陆地棉叶绿体密码子第三位偏好使用嘧啶,而最优密码子多以^或T结尾;密码子使用模式可能是由选择和突变及其它因素共同作用形成的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王坤波	中国农业科学院棉花研究所	18	251	9.0	15.0
2	刘方	中国农业科学院棉花研究所	31	456	13.0	21.0
3	华金平	中国农业大学农学与生物技术学院	11	169	8.0	11.0
4	尚明照	华中农业大学植物科学技术学院	1	48	1.0	1.0