基于转录终点序列特征预测大肠杆菌sRNA

• 作者: 刘倩 吴佳瑶 应晓敏 李伍举 查磊
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 细菌sRNA 终点信号 预测
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 257-264
• 页数: 8页
• 分类号: Q937
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2011.00257

摘要

细菌sRNA是一类长度在40～500 nt的调控RNA,在细菌与环境相互作用中发挥重要功能,因此,细菌sRNA识别研究具有重要意义.然而,与蛋白编码基因具有易于识别的特征不同,目前细菌sRNA识别仍是一件比较困难的事.此方法介绍了一个基于己知细菌sRNA转录终点的碱基频率矩阵来识别sRNA的预测策略,并在大肠杆菌K-12 MG1655中进行了sRNA的预测.结果表明,该模型在独立测试集中具有较高的特异性和阳性检出率,因此,这一方法将为实验发现细菌sRNA提供较好的生物信息学支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	应晓敏		3	9	1.0	3.0
2	查磊		2	0	0.0	0.0
3	李伍举		4	0	0.0	0.0
4	刘倩		1	0	0.0	0.0
5	吴佳瑶		1	0	0.0	0.0