两个南方花生主栽品种荚果与叶片基因表达谱分析

• 作者: 刘海燕 周桂元 张二华 朱方何 李少雄 李杏瑜 梁炫强 洪彦彬 温世杰 钟旎 陈小平
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 花生栽培种 基因芯片 基因表达谱 差异表达基因 实时定量RT-PCR
• 年，卷（期）: 2011,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1378-1388
• 分类号: S565.201
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.01378

摘要

利用高密度花生基因表达谱芯片比较遗传背景相似而在产量上存在显著差异的2个南方花生品种粤油7号和汕油523荚果与叶片的基因表达谱.结果表明,汕油523与粤油7号荚果差异表达基因高达1383个,其中上调表达基因662个,下调表达基因721个.叶片中差异表达基因有647个,其中上调表达基因234个,下调表达基因413个.基因表达差异在10倍以上的上调和下调基因在荚果中分别有52个和105个,而在叶片中只有2个和5个.功能注释结果表明,差异表达基因集中在细胞内和膜上,而其分子功能主要为结合和催化活性,主要参与代谢、细胞和生物调控等生物过程.在花生荚果和叶片中,还有近一半的差异表达基因的功能未知,表明这2个器官中还有大量的基因尚待发掘.为验证基因芯片数据的可靠性和重复性,选择4个差异表达基因进行实时定量PCR分析,其结果与芯片检测结果吻合.