孵化酶是后生动物卵孵化过程中起关键作用的一类蛋白酶.基于生物信息学和RACE方法,从柞蚕胚胎中克隆了一个998 bp的孵化酶样基因全长cDNA,命名为ApHEL(GenBank登录号:JN205047).ApHEL由15bp5'-UTR,98 bp 3'-UTR和885 bp ORF组成.ORF编码294个氨基酸残基,预测蛋白分子质量为33.51 kD,等电点为5.50.在ApHEL N-端存在16个氨基酸的信号肽.ApHEL蛋白酶功能区中合有锌结合序列(HEWMHILGFLHMQSTHNR)和Met-转角基序(YDYVSCLHY)等孵化酶保守功能区域.ApHEL与其他物种孵化酶氨基酸序列的相似度为30.0%~85.0%.基于孵化酶氨基酸序列的进化分析表明,柞蚕、家蚕、库蚊和果蝇聚为一类,亲缘关系较近.ApHEL在早期胚胎中没有转录,至催青第6天开始转录并维持较低水平,在催青第9天剧增至最高值直至孵化,显示ApHEL在柞蚕卵孵化过程中起重要作用.ApHEL在5龄期幼虫的中肠组织中特异性表达,暗示ApHEL可能还有其他生物学功能.