瘤背石磺线粒体基因组全序列分析

• 作者: 张坤霞 张雨 方磊 沈和定 陈诚 魏峦峦
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 瘤背石磺 线粒体基因组 序列分析 系统进化树
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 493-500
• 分类号: Q785|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17047

摘要

采用LA-PCR技术对瘤背石磺线粒体基因组全序列进行了测定和分析.结果表明,瘤背石磺线粒体基因组序列全长13 957bp,由22个tRNA、2个rRNA、13个蛋白编码基因和19个长度为2～138BP的非编码区组成.4个蛋白质编码基因和8个tRNA基因从L链编码,其余基因均从H链编码.蛋白质基因的起始密码子,除ND2为TTG以外,均为典型的起始密码子ATN.COⅢ和Cytb基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均使用典型的TAA或TAG.预测了22个tRNA基因的二级结构,发现tRNAser缺少DHU臂,tRNAser和tRNAThr的反密码子环上有9个碱基,而不是通常的7个碱基.最长的非编码区含有类似于tRNA的二级结构.基于线粒体基因组编码的13个蛋白质的氨基酸序列,用NJ、MP、ME和UPGMA法构建系统进化树.分析6种软体动物之间的亲缘关系,结果与传统的系统分类基本一致.研究初步确定瘤背石磺与平疣桑椹石磺的亲缘关系比与凯尔特石磺的亲缘关系近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈和定	上海海洋大学水产与生命学院	71	477	13.0	17.0
2	陈诚	上海海洋大学水产与生命学院	6	44	4.0	6.0
3	魏峦峦	上海海洋大学水产与生命学院	5	39	4.0	5.0
4	张雨	上海海洋大学水产与生命学院	6	94	3.0	6.0
5	方磊	上海海洋大学水产与生命学院	5	38	3.0	5.0
6	张坤霞	上海海洋大学水产与生命学院	3	35	3.0	3.0