三角帆蚌CAT基因cDNA全长克隆及表达分析

• 作者: 李家乐 李西雷 汪桂玲 白志毅 袁一鸣
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 过氧化氢酶(CAT) 基因表达 RACE-PCR
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 481-492
• 分类号: Q785|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17149

摘要

采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804bp,包含112bp的5'非翻译区(untranslated region,UTR),1 303bp的3'UTR和1 388 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF).ORF区共编码462个氨基酸,推算的分子量约为52.7 ku,理论等电点为6.35.多序列比对结果显示,有一段CAT氨基酸高度保守的催化位点序列FDRERIPERVVHAKGAG.三角帆蚌CAT基因有12个与还原型辅酶Ⅱ(NADPH)结合的氨基酸残基,分别是Asp107、His153、Phe157、Ser160、Arg162、Asn172、Try174、Lys196、Val261、Trp262、His264和Try317,其中第261位和第264位的氨基酸在不同物种间有所区别.比对结果得到的三角帆蚌CAT基因的氨基酸序列,与软体动物的CAT基因相似性高达99%,与虾类、鱼类、两栖类、哺乳类的CAT基因相似性也达到98%～99%,可推断属于CAT3.利用CAT基因推断得到的氨基酸序列构建NJ系统树,分析显示三角帆蚌首先与软体动物聚在一起,再与虾类聚在一起,然后依次与鱼类、两栖类和哺乳类聚在一起.荧光定量结果显示,CAT基因在三角帆蚌的7个组织均有表达,其中在肾中的表达量极低,在血液中表达呈上调趋势且明显区别于其他组织,在另外5个组织中总体上呈现不统一的先上调后下调的趋势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白志毅	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	36	253	9.0	14.0
2	汪桂玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	33	196	9.0	12.0
3	李西雷	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	6	42	4.0	6.0
4	袁一鸣	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	3	31	3.0	3.0