一种基于关联图的蛋白质结构预测改进算法

• 作者: 杨根科 潘常春 陆恒云
• 来源期刊: 上海交通大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 关联图 蛋白质 结构预测 COMAR算法
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 96-100
• 页数: 5页
• 分类号: Q71
• 语种: 中文

摘要

采用一种改进的COMAR(Contact Map Reconstruction)算法求解基于关联图的蛋白质结构预测问题.根据蛋白质关联图和先验知识,并以半随机的方式生成距离信息,根据距离信息得到蛋白质的坐标,并通过坐标修正和摄动,使得重构结构的关联图与给定的关联图相一致.结果表明,阈值较大的关联图所重建的结构较好,与原COMAR算法相比,在相同的迭代次数下,改进的COMAR算法的精度较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨根科		84	740	14.0	24.0
2	陆恒云		5	59	4.0	5.0
3	潘常春		18	95	6.0	9.0