热胁迫下丹参转录组cDNA-AFLP分析

• 作者: 吴先军 李东 陈新
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 丹参 热胁迫 cDNA-AFLP 转录组 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2011,（10）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2083-2091
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文

摘要

目的 探索热胁迫影响丹参生长和次生代谢的分子机制.方法 采用cDNA-AFLP技术对丹参热胁迫下叶片基因表达进行转录组分析.采用EcoR Ⅰ和Mse Ⅰ对叶片cDNA进行双酶切,256对引物组合进行选择性扩增,对差异片段进行测序、功能分析和定量RT-PCR.结果 共分离出196个差异表达转录衍生片段(transcription derived fragments,TDFs),其中增强与诱导表达的TDFs 122条,抑制表达的74条；从NCBI中鉴定出147个同源TDFs,另有49个TDFs为新发现序列.结论 热胁迫影响转录组的信号转导、转录调控、逆境响应蛋白、物质代谢等多个方面,为进一步研究丹参有效成分的代谢调控奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈新		41	425	12.0	19.0