曼氏无针乌贼肌肉cDNA文库的构建和表达序列标签分析

• 作者: 曾建刚 王佳 蒋霞敏 薛良义
• 来源期刊: 台湾海峡
• 学科: 生物学
• 关键词: 海洋生物学 曼氏无针乌贼 肌肉组织 cDNA文库 表达序列标签(ESTs)
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 论文与报告
• 页码范围: 357-362
• 分类号: Q178.53
• 字数: 4066字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1000-8160.2011.03.009

摘要

以曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)肌肉组织为研究材料,利用Clontech公司的cDNA文库构建试剂盒构建了曼氏无针乌贼肌肉cDNA文库.对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量约为1.2×106克隆(cfu/dm3),重组率达96％,插入片段平均长度大于1 000 bp.挑取568个阳性克隆进行5’末端测序,其中475条ESTs长度大于100 bp,初步拼接后得到200个单基因簇,包括41个重叠群和159个单拷贝EST,冗余度为57.89％.经检索,53条ESTs(占比为26.5％)在BLASTx上无明显的同源性(E值≥1.00×10 -10),为新基因.147条ESTs(占比为73.5％)与已报道的基因有较高的同源性；其中与能量相关基因的ESTs丰度最高,占总数的23.0％.细胞信号传导、细胞骨架和蛋白质代谢的次之,比例分别为17.5％、12.5％、9.5％,其中包括热激蛋白70、转铁蛋白等.这些EST数据有助于进一步筛选和克隆曼氏无针乌贼和其他头足动物的肌肉特异性表达基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋霞敏	宁波大学生命科学与生物工程学院	162	1857	21.0	33.0
2	薛良义	宁波大学生命科学与生物工程学院	82	601	14.0	21.0
3	王佳	宁波大学生命科学与生物工程学院	5	3	1.0	1.0
4	曾建刚	宁波大学生命科学与生物工程学院	3	24	2.0	3.0