梨属叶绿体非编码区trnL-trnF和accD-psaI特征及其在系统发育研究中的应用价值

• 作者: 滕元文 胡春云 郑小艳
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梨属 trnL-trnF accD-psaI 长度突变 系统关系
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 2261-2272
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文

摘要

对梨属19个种共26个供试样本及两个苹果属外类群样本的叶绿体非编码区trnL-trnF和accD-psaI进行了序列分析。排列后的序列长度分别为927 bp和944 bp。两个区域组合后共有36个核苷酸替换（substitution）和11个插入/缺失（indel）。将所有indel处理为一次变异事件并编码为替换,用于简约法系统树和NeighborNet系统发育网络（phylogenetic networks）的构建。研究结果表明：indel为系统发育分析提供了可靠的信息;相比trnL-trnF,accD-psaI因进化速率较快,更适合应用于种及种以下分类水平的梨属植物系统关系研究;NeighborNet系统发育网络表明系统树上部分较低的分支支持率由冲突的信息引起,其余则由信息位点不足引起。此外结果还揭示了可疑种间杂交种的母系祖先。