荧光小分子2-氨基-5,6,7-三甲基-1,8-萘啶识别dsDNA中胞嘧啶凸出

• 作者: 张成孝 漆红兰 胡亮亮 薄红艳 高强
• 来源期刊: 中国科学（化学）
• 关键词: 荧光 胞嘧啶凸出 2-氨基-5,6,7-三甲基 -1,8-萘啶 氢键 识别
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1732-1739
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/032011-232

摘要

双链DNA (dsDNA)中单碱基凸出结构(bulge structure)具有重要生物学意义,这种结构也是DNA靶向药物的目标部位之一.荧光小分子2-氨基-5,6,7-三甲基-1,8-萘啶(ATMND)能够通过氢键识别胞嘧啶(cytosine),因而对dsDNA中凸出的胞嘧啶表现出明显的特异性结合.与其余三种凸出的碱基相比,ATMND与凸出部位胞嘧啶的结合伴随着ATMND荧光的明显猝灭,因而可以用于胞嘧啶凸出结构的识别.利用解旋温度测量、荧光、圆二色光谱对ATMND和存在胞嘧啶凸出结构的dsDNA相互作用进行了研究.荧光滴定结果表明ATMND和dsDNA中凸出部位未配对的胞嘧啶的结合常数K11=4.8×105M-1.通过对含胞嘧啶凸出结构的dsDNA与ATMND结合前后的解旋温度曲线进行解析,发现胞嘧啶凸出结构相邻碱基对凸出的胞嘧啶与ATMND的结合有较大的影响.荧光测量结果也表明ATMND荧光的猝灭效率与凸出结构相邻碱基的类型有关,当相邻碱基为鸟嘌呤(guanine,G)时,荧光猝灭效率最高.基于dsDNA中凸出的碱基对ATMND荧光猝灭效率存在明显差异这一现象,设计了探针DNA实现了乳腺癌相关基因(PGR gene rs3740753)中单核苷酸多态性(G/C变异)的荧光分型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张成孝		52	417	13.0	18.0
2	漆红兰		33	340	10.0	18.0
3	高强		8	10	1.0	3.0
4	薄红艳		3	9	1.0	3.0
5	胡亮亮		1	0	0.0	0.0