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摘要:
以简并引物通过RT-PCR从重要经济海水鱼类棕点石斑鱼Epinephelus uscoguttatus白细胞中扩增出一条388bp具有完整编码框的cDNA序列.Blast分析初步显示,该序列属于鱼类抗菌肽Piscidin家族的一员,将其命名为棕点石斑鱼Piscidin样肽(GU592793),推导氨基酸序列具有界定鱼类Piscidin的以下共同特征:(1)预测的信号肽序列与其他Piscidin的同源性较高,在60%~95%之间;(2)推测的成熟肽N端6个氨基酸残基富含Phe、Ile及His;(3)成熟肽第8个和第13个氨基酸位点均为Gly.NJ进化树分析表明,该cDNA推导的氨基酸序列与赤点石斑鱼Epinephelusakaara piscidin-like peptide (ACE78290)、斜带石斑鱼Epinephelus coioides Piscidin-like peptide(ACE78291)以高达81%的支持率聚为一支.也表明本研究成功克隆到棕点石斑鱼首条PiscidincDNA序列.推测的成熟肽为两亲性阳离子肽,等电点12.48,Schiffer-Edmunson预测其二级结构呈a螺旋构型.将推测的成熟肽序列亚克隆至pET-32a构建融合表达载体pET-32a-pis(EF),并在大肠杆菌 E.coli Origami(DE3)中成功表达出融合蛋白,以1mmol/ml IPTG于30℃进行诱导表达,4h可获得大量表达,目的蛋白以包涵体形式存在.
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文献信息
篇名 棕点石斑鱼Piscidin样肽基因的克隆及其成熟肽的原核表达
来源期刊 渔业科学进展 学科 农学
关键词 抗菌肽 Piscidin 基因克隆 原核表达 棕点石斑鱼
年,卷(期) 2011,(4) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 126-133
页数 分类号 S917
字数 5846字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-7075.2011.04.019
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘志刚 深圳大学医学院 324 1724 17.0 23.0
2 邓利 深圳大学生命科学学院 22 200 10.0 13.0
3 陈大玮 深圳大学生命科学学院 7 61 5.0 7.0
4 邱聪龄 深圳大学生命科学学院 2 4 1.0 2.0
5 何凡 深圳大学生命科学学院 2 6 2.0 2.0
6 马一见 深圳大学生命科学学院 2 17 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
抗菌肽
Piscidin
基因克隆
原核表达
棕点石斑鱼
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
渔业科学进展
双月刊
1000-7075
37-1466/S
大16开
山东省青岛市南京路106号(黄海水产研究所)
24-153
1980
chi
出版文献量(篇)
2367
总下载数(次)
4
总被引数(次)
28561
论文1v1指导