Discovery Studio2.0的模块扩展及应用:残基水平非键相互作用能量的自动批量计算

• 作者: 高跃东 黄京飞
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 工学
• 关键词: 非键相互作用 模块扩展 Discovery Studio 2.0
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 262-266
• 分类号: Q5-3|Q811.4|TP399
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2011.03262

摘要

非键相互作用对于生物体系中的分子识别和结合过程起着关键作用.然而,传统的方法并不能在残基水平自动批量计算非键相互作用.近年来,已经发展了一些方法和工具进行非键相互作用的计算分析.该文研究发展了一种可以自动计算残基间非键相互作用的方法,即用Perl脚本调用Discovery Studio 2.0(DS2.0,Accelrys Inc.)底层模块中的非键相互作用协议,实现了直接利用命令行批量计算非键相互作用能量,而无需通过DS2.0的图形界面.该方法扩展了DS2.0的计算模块,并于近期运用到了复合结构的研究分析中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高跃东	中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室	2	9	1.0	2.0