骨质疏松症遗传相关基因的生物信息学研究

• 作者: 刘梅洁 吕爱平 张治国 李艳 牛旭艳 鞠大宏
• 来源期刊: 中国骨质疏松杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 骨质疏松症 在线人类孟德尔遗传数据库 蛋白质相互作用网络 分子复合物 基因本体论
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 279-290
• 分类号: R681
• 字数: 4677字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-7108.2011.04.001

摘要

目的 建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,发现其中其中包含的分子复合物和未经研究或研究较少的与骨质疏松症相关的蛋白质.方法 基于OMIM数据库中与骨质疏松症发生相关的177个遗传基因,应用 Cytoscape软件及其插件Agilent Literature Search,进行PUBMED文献的文本数据挖掘,建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络;应用MCOMD算法,探测网络中的分子复合物,并对分子复合物包含的蛋白质进行GO分析,分析包括分子功能、生物学通路、细胞组分.结果 骨质疏松症的蛋白质相互作用网络包含863个节点(蛋白质)、2925条边(相互作用关系)、4个高度关联的分子复合物.这些分子复合物内的18个蛋白质与骨质疏松症的关系未经研究或研究较少.结论 基于OMIM数据库,可建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络,发现未经研究或研究较少的骨质疏松症关联蛋白质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕爱平	中国中医科学院中医临床基础医学研究所	192	2762	28.0	39.0
2	鞠大宏	中国中医科学院中医基础理论研究所	67	923	15.0	28.0
3	张治国	中国中医科学院中医基础理论研究所	38	60	5.0	6.0
4	李艳	中国中医科学院中医基础理论研究所	18	196	6.0	14.0
5	刘梅洁	中国中医科学院中医基础理论研究所	23	118	7.0	10.0
6	牛旭艳	中国中医科学院中医临床基础医学研究所	4	100	3.0	4.0