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微卫星标记在不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定的适用性
微卫星标记在不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定的适用性
作者:
吴彪
周丽青
李霞
杨爱国
程鹏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
微卫星
壳色
虾夷扇贝
亲权鉴定
等位基因
摘要:
实验选取8个多态性微卫星位点,用于虾夷扇贝4个不同壳色全同胞和半同胞家系160个子代的亲权鉴定.在亲本未知和一亲本已知的情况下,8个微卫星位点累积排除概率分别为0.823和0.961.鉴于亲权分析时子代的亲本在已知和未知情况下位点的累积排除概率不同,实验采用了两种方法用于家系的亲权鉴定.方法1:当子代的父母本情况未知时,根据子代基因型数据,通过CERVUS 2.0软件计算子代所对应的候选亲本的LOD值,直接将候选亲本中具有最大的两个LOD值的亲本确定为子代的父母本;方法2:在子代的亲本未知情况下,视具有最大LOD值的候选亲本为子代的第一候选亲本,然后将该亲本视为已知,通过CERVUS 2.0软件重新计算每个侯选亲本的LOD值,再从中选择具有最大LOD值的候选亲本作为该子代的第二候选亲本.结果表明,采用方法2得到的家系亲权鉴定成功率达到95%以上,确定了微卫星标记在虾夷扇贝家系鉴定中的可行性.所检测的微卫星位点在子代中出现无效等位基因现象,而无效等位基因存在会引起子代与亲本的错配.实验在家系鉴定时采用了无效等位基因存在(情况1)和缺失(情况2)两种子代基因型文件进行分析,不同情况下同一方法家系鉴定成功率相差无几.这表明了基于多个微卫星位点计算候选亲本LOD值大小寻找子代真实父母本可以降低由无效等位基因引起的错配的几率.研究表明了微卫星标记适合于不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定工作.
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文献信息
篇名
微卫星标记在不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定的适用性
来源期刊
水生生物学报
学科
生物学
关键词
微卫星
壳色
虾夷扇贝
亲权鉴定
等位基因
年,卷(期)
2011,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
768-775
页数
分类号
Q173
字数
5617字
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1035.2011.00768
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
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1
李霞
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杨爱国
中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室
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周丽青
中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室
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吴彪
中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室
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程鹏
中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室
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传播情况
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引文网络
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水生生物学报
主办单位:
中国科学院水生生物研究所
中国海洋湖沼学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-3207
CN:
42-1230/Q
开本:
大16开
出版地:
湖北省武汉市武昌珞珈山水生所 (武昌东湖南路7号)
邮发代号:
82-329
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
3348
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8
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