基于matK 基因和ITS 序列探讨大叶藻科的系统发育关系

• 作者: 孙典荣 李文涛 李渊 高天翔
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: ITS matK 大叶藻科 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 页码范围: 900-907
• 分类号: Q949|Q75
• 字数: 5690字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00900

摘要

比较分析了15 种大叶藻的matK 基因和ITS 片段的核苷酸序列,结果发现胞嘧啶(C)在两个目的片段上含量均较低.ITS 基因片段检测到228 处核苷酸替换,表现出丰富的遗传多态性; matK 基因片段上有249处核苷酸替换,且大部分替换来自于第三密码子的同义替换,种间在氨基酸水平上产生了一定的分化.基于matK 基因和ITS 片段,利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树结果基本一致,明显分为4 大支,大叶藻亚属、异叶藻属、拟大叶藻亚属和虾形藻属分别构成一支.大叶藻亚属和拟大叶藻亚属的核苷酸差异值在29.09%-35.51%,超过了屈良鹄等提出的大部分被子植物ITS 属间核苷酸差异值(9.60%-28.80%),在分子数据上两亚属都达到了属的水平.研究结果支持Tomlinson 和Posluszny 对大叶藻科的划分结果,建议将大叶藻科分为4 个属.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李渊	中国海洋大学水产学院	15	171	9.0	12.0
2	孙典荣	中国水产科学研究院南海水产研究所	37	640	16.0	24.0
3	高天翔	中国海洋大学水产学院	154	2739	28.0	41.0
4	李文涛	中国海洋大学水产学院	52	566	14.0	22.0