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禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征
禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征
作者:
华育平
张兰兰
张玉稳
曾祥伟
王建琪
程成
原文服务方:
东北林业大学学报
禽流感病毒
H3N8亚型
野鸭源分离株
序列分析
摘要:
根据已知禽流感病毒(AIV)的8个基因序列设计合成12对特异引物,通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,分别成功扩增出分离于野鸭(Mallard)的1株H3N8亚型禽流感病毒的全基因片段,将其分别克隆到pMD18-T载体后进行序列测定.同时将8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较,绘制各基因的进化树.结果表明:所克隆到的8个片段均包含相应病毒基因的完整开放阅读框架,长度分别为PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp核苷酸,分别编码759、758、716、577、498、470、252/96、230/125个氨基酸.K/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株HA有7个潜在糖基化位点;在HA裂解位点序列为PEKQTR↓ GLF,无连续的多个碱性氨基酸插入,具有典型的低致病性禽流感病毒特征.根据A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株与参考毒株的序列比较分析结果推测,该分离株可能是不同亚型禽流感病毒通过互相基因交换所形成的基因重组体.
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文献信息
篇名
禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
禽流感病毒
H3N8亚型
野鸭源分离株
序列分析
年,卷(期)
2011,(3)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
92-95
页数
分类号
S852.65
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-5382.2011.03.027
五维指标
作者信息
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单位
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1
曾祥伟
62
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8.0
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华育平
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张玉稳
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程成
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4.0
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H3N8亚型
野鸭源分离株
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
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