基因芯片技术筛选人不同发育阶段表皮干细胞差异表达基因的研究

• 作者: 刘德伍 彭燕 易先锋 李国辉 毛远桂 王联群 蓝蔚 钟清玲 陈桦
• 来源期刊: 中华烧伤杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 表皮 干细胞 基因 芯片分析技术 发育
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 26-31
• 分类号: R6
• 字数: 4965字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-2587.2011.01.008

摘要

目的 分析人不同发育阶段表皮干细胞基因表达变化特征,探讨其可能的生物学意义.方法 收集胎龄28～32周胎儿、4～12岁少儿、35～55岁成人3组正常皮肤组织标本,每组10例.采用胰蛋白酶和乙二胺四乙酸联合消化法分离表皮,Ⅳ型胶原快速黏附法分离、纯化表皮干细胞,免疫细胞化学染色法行整合素β1、角蛋白19单克降抗体检测鉴定.Trizol一步法分别提取各组细胞总RNA,琼脂糖甲醛变性凝胶电泳质检.制备探针并与表达谱芯片进行杂交,扫描芯片荧光信号图像.对芯片图像进行分析,以2倍差异表达值筛选差异表达基因.选择明显上调或下凋的基因,用实时RT-PGR技术进一步验证相关基因.结果 与少儿组比较,成人组差异表达基因1808个,其中上调的基因1089个、下调的基因719个,已知基因1462个、未知基因346个.少儿组样本与胎儿组比较,差异表达基因4534个,其中上调的基因1783个、下调的基因2751个,已知基因3577个、未知基因957个.根据基因功能分类,成人组与少儿组差异表达基因可分为128类,少儿组与胎儿组差异表达基因可分为216类.1104个基因在胎儿组、少儿组与成人组样本中呈持续差异表达,根据基因功能分为32类.实验检测到持续差异表达基因中,有94个差异表达基因呈持续上调状,75个差异表达基因呈持续下调趋势.实时RT-PCR验证结果与芯片筛选结果一致.结论 体外培养的胎儿、少儿与成人表皮干细胞基因表达谱有明显不同,其差异可能与不同发育阶段人表皮干细胞的增殖分化能力及皮肤创伤修复能力不同密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭燕	南昌大学第一附属医院烧伤科	40	264	10.0	13.0
2	王联群	南昌大学第一附属医院烧伤科	17	83	5.0	8.0
3	刘德伍	南昌大学第一附属医院烧伤科	90	487	12.0	14.0
4	易先锋	广东省工伤康复医院烧伤康复科	23	108	6.0	9.0
5	毛远桂	南昌大学第一附属医院烧伤科	32	164	8.0	10.0
6	李国辉	南昌大学第一附属医院烧伤科	58	279	9.0	13.0
7	钟清玲	南昌大学第一附属医院烧伤科	83	635	13.0	20.0
8	蓝蔚	广东省工伤康复医院烧伤康复科	13	62	5.0	7.0
9	陈桦	南昌大学第一附属医院烧伤科	1	3	1.0	1.0