西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析

• 作者: 孙亮先 游燕琳 郑华军 黄周英
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 西方蜜蜂 5'LongSAGE 表皮蛋白 apd-like基因 转录起始位点(TSS)
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 224-231
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

Apidermin蛋白家族是根据蜜蜂表皮蛋白apidermin 1-3(APD 1-3)而命名的一个新型的昆虫结构性表皮蛋白家族.为了鉴定西方蜜蜂Apis mellifera 基因组序列上毗邻基因簇apd 1-3的一个预测基因座LOC727145是否为一个新的apd因,本研究在用5'LongSAGE标签定位该基凶的转录起始位点(TSS)的基础上,利用其中的3条5'LongSAGE标签序列作为上游引物,通过RT-PCR方法克隆了该基因的cDNA序列(GenBank登录号:GU358197,GU358199,GU358198).牛物信息学分析发现,基因座LOC727145含有2个外显子和1个"GT-AG"型内含子,其cDNA序列富含GC(70%),可编码一条长152 aa残基的高度疏水性多肽.此多肽序列的氨基酸组成与蜜蜂APD1-3表皮蛋白类似,富含Ala,Gly,Pro,Leu和Val 5种氨基酸(占77%),其中Ala残基含量最高(29%).该多肽序列与蜜蜂APD-1表皮蛋白序列的相似性为50%,且其N末端的预测信号肽序列与APD蛋白的信号肽序列类似.5'LongSAGE标签的基因组定位结果显示,基因座LOC727145在雄蜂头部中表达丰度很高,RNA Pol Ⅱ可从6个不同的TSS上以不同效率起始转录,其中由一个优势TSS上起始了90%的转录.本研究为apidermin表皮蛋白家族增添了一个新成员,命名为apidermin-like(apd-like).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙亮先	泉州师范学院分子生物学与药物化学福建省高等学校重点实验室	41	278	9.0	14.0
2	黄周英	泉州师范学院分子生物学与药物化学福建省高等学校重点实验室	36	315	10.0	16.0
3	郑华军		4	14	2.0	3.0
4	游燕琳	泉州师范学院分子生物学与药物化学福建省高等学校重点实验室	1	6	1.0	1.0