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合浦珠母贝C-型凝集素基因的序列特征和功能分析
合浦珠母贝C-型凝集素基因的序列特征和功能分析
作者:
崔淑歌
张殿昌
江世贵
胡钰婷
郭华阳
陈明强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
合浦珠母贝
C-型凝集素基因
RT-PCR
原核表达
摘要:
通过EST筛选结合重测序法获得合浦珠母贝一种C-型凝集素cDNA的全长序列(命名为PoLEC1).PoLEC1全长988 bp,5′-UTR为33 bp,3 ′-UTR为101 bp,开放阅读框为864 bp,编码287个氨基酸,分子量为31.68 ku,理论等电点约5.83.预测的氨基酸序列中含有信号肽( Met1 -Ser19)和糖结合位点.同源性分析结果表明,PoLEC1与其它物种C-型凝集素的的糖识别结构域序列的同源性在18.8% ~28.6%,相似性在28.9%~50.0%之间.进化树分析结果表明,PoLEC1与栉孔扇贝聚为一支.组织表达分析表明,PoLEC1 mRNA在消化腺、外套膜、性腺、闭壳肌、肠、鳃和血淋巴组织均有表达,在消化腺中的表达分析表明,经溶藻弧菌刺激后2h表达显著下调,而在4和24 h后表达显著上调.利用PoLEC1成熟肽构建原核表达载体,在大肠杆菌中进行重组表达.制备包涵体后,用IDA HisBind树脂纯化得到单一的重组蛋白,凝菌试验表明该蛋白对大肠杆菌有明显的凝集作用.
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内容分析
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相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
合浦珠母贝C-型凝集素基因的序列特征和功能分析
来源期刊
水产学报
学科
农学
关键词
合浦珠母贝
C-型凝集素基因
RT-PCR
原核表达
年,卷(期)
2011,(9)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1327-1336
页数
分类号
Q753|S917.4
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1231.2011.17382
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张殿昌
中国水产科学研究院南海水产研究所
35
385
13.0
18.0
2
陈明强
中国水产科学研究院南海水产研究所
13
138
7.0
11.0
3
郭华阳
上海海洋大学水产与生命学院
7
89
6.0
7.0
5
胡钰婷
上海海洋大学水产与生命学院
1
18
1.0
1.0
9
崔淑歌
1
18
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(67)
共引文献
(35)
参考文献
(23)
节点文献
引证文献
(18)
同被引文献
(38)
二级引证文献
(39)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
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二级参考文献(2)
1977(1)
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参考文献(0)
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1985(2)
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参考文献(1)
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参考文献(0)
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2011(2)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
2014(3)
引证文献(3)
二级引证文献(0)
2015(4)
引证文献(2)
二级引证文献(2)
2016(5)
引证文献(1)
二级引证文献(4)
2017(13)
引证文献(4)
二级引证文献(9)
2018(20)
引证文献(4)
二级引证文献(16)
2019(8)
引证文献(2)
二级引证文献(6)
2020(3)
引证文献(1)
二级引证文献(2)
研究主题发展历程
节点文献
合浦珠母贝
C-型凝集素基因
RT-PCR
原核表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
水产学报
主办单位:
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-0615
CN:
31-1283/S
开本:
大16开
出版地:
上海市临港新城沪城环路999号
邮发代号:
4-297
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
3756
总下载数(次)
11
总被引数(次)
60406
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