利用生物信息学方法对人类(Homo sapiens)肌肉增强因子2(MEF2)的特性比较及进化分析

• 作者: 郭新军
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 人类肌肉增强因子2 生物信息学 进化 结构域 序列比对
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 975-981
• 分类号: Q987
• 字数: 4096字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00975

摘要

肌肉增强因子2(Myocyte enhancer factor 2,MEF2)是MADS(MCM1,agamous,deficiens和serum response factor)家族成员之一,在动物发育过程中起到重要的调节作用.为了进一步了解其调控的复杂性,本文根据NCBI中已有的人类MEF2相关数据,应用ExPASy在线序列分析工具、CBS在线分析服务器软件、Conserved Domain Database(CDD)数据库、SABLE在线分析软件等对人类MEF2蛋白的不同亚型序列进行比较分析,同时,根据相关序列的比对结果构建系统进化树进行分析.结果表明,MEF2在人体内以多种蛋白形式存在,其理化性质存在一定差别,可能的翻译后糖基化修饰多为O型糖基化且均存在较多磷酸化位点.人类各MEF2蛋白具明显MADS结构域,多数具有MEF2结构域和HJURP_C结构域.各MEF2蛋白二级结构均包括了螺旋、折叠和无规则卷曲等多种形式,其三级结构模式相似.系统进化树显示MEF2B蛋白与其他蛋白有着较大的序列差异及较远进化关系,可能较为原始.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭新军	西安文理学院生命科学系	10	53	4.0	7.0