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水稻Sn5基因的分子进化及功能比较
水稻Sn5基因的分子进化及功能比较
作者:
MUHAMMAD Qasim Shahid
仝静飞
刘向东
卢永根
李艳红
李金泉
杨有新
王兰
陈志雄
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水稻(Oryza sativa L.)
杂种不育性
Sn5
广亲和基因
普通野生稻(O.rufipogon)
尼瓦拉野生稻(O.nivara)
摘要:
Sn5基因是克服水稻亚种间杂种胚囊不育性最主要因子之一,了解其序列特征对于揭示其起源或进化以及在分子育种上的应用具有重要意义.本文以48份携带有Sn5的栽培稻品种和野生稻为材料,通过对其Sn5的全序列进行测定,并选择在编码区序列差异较大的品种(系)与籼粳测验种进行测交组配F1,研究不同序列Sn5在克服水稻亚种间杂种胚囊不育性效应的差异.结果表明,48份材料的DNA全序列与对照02428完全一致的有15份,其他33份存在不同程度的变异.变异位点,包括颠换、转换和缺失等,共有24个.编码区的变异主要发生在外显子2,其中变异最大的8份材料在1710~1719 bp处缺失了10个碱基,包括尼瓦拉野稻IRW501和栽培稻品种粤泰B等.S5n序列变异没有偏向性,说明Sn5是中性进化基因.通过构建Sn5全序列及其编码区编码氨基酸系统NJ树,将48份材料归为4类,其中大部分的栽培稻聚成一类,普通野生稻聚成一类,8份缺失10个碱基的材料聚为一类,其他的材料聚成一类.利用WE-CLSM(whole-mount eosin B-staining confocallaser scanning microscopy)对测交F1的胚囊育性观察表明,不同Sn5序列材料组配测交F1的胚囊育性均比对照明显增加,彼此间没有显著差异,显示它们都能克服亚种间的胚囊不育性,也间接证明Sn5是功能缺失基因.
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假基因
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进化
生物信息学
水稻Xa-5基因在水稻和玉米中的比较物理定位
BAC FISH
原位杂交Xa-5
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篇名
水稻Sn5基因的分子进化及功能比较
来源期刊
科学通报
学科
关键词
水稻(Oryza sativa L.)
杂种不育性
Sn5
广亲和基因
普通野生稻(O.rufipogon)
尼瓦拉野生稻(O.nivara)
年,卷(期)
2011,(15)
所属期刊栏目
论文
研究方向
页码范围
1204-1212
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.1007/s11434-011-4534-8
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
刘向东
63
1027
18.0
30.0
2
王兰
18
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3
卢永根
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1335
22.0
35.0
4
李金泉
27
306
10.0
16.0
5
陈志雄
13
22
3.0
4.0
6
仝静飞
1
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李艳红
1
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杨有新
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科学通报
主办单位:
中国科学院国家自然科学基金委员会
出版周期:
旬刊
ISSN:
0023-074X
CN:
11-1784/N
开本:
大16开
出版地:
北京东城区东黄城根北街16号
邮发代号:
80-213
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
11887
总下载数(次)
74
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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