合作猪γ-IFN基因外显子4多态性分析

• 作者: 张小丽 李娟娟 李小飞 王立贤 罗玉柱 马小军 魏恒
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 合作猪 γ-IFN基因 PCR-SSCP 多态性
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 24-27
• 分类号: S828
• 字数: 3102字
• 语种: 中文

摘要

为了研究合作猪γ-IFN基因的多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点,各等位基因是否符合Hardy-Weinberg平衡状态、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度,采用PCR-SSCP方法检测了138头合作猪γ-IFN基因外显子4的等位基因,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因序列,就基因型和等位基因单倍型序列数据开展分析.序列比对分析发现5个核苷酸多态位点,其中5 284 bp(A→G)、5 341 bp(G→A)、5 371 bp(A→G)为新发现突变位点.试验群体发现4种基因型AA、AB、AC和AD,其中A等位基因频率为0.963 8,为优势等位基因.经x2适合性检验,该群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).γ-IFN基因遗传多态指数中,杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)均较低,表明合作猪γ-IFN基因比较保守.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王立贤	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	90	755	17.0	24.0
2	马小军	甘肃农业大学动物医学院	47	132	6.0	9.0
4	张小丽	甘肃农业大学动物医学院	36	74	4.0	7.0
5	罗玉柱		13	96	7.0	9.0
6	魏恒	渭南职业技术学院畜牧兽医系	20	48	4.0	6.0
7	李娟娟	渭南职业技术学院畜牧兽医系	17	35	3.0	4.0
10	李小飞	甘肃农业大学动物医学院	2	10	1.0	2.0