“全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析

• 作者: 冯维 刘至治 李雪松 王成辉 赵雪锦 马晓茜
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 瓯江彩鲤 主要组织相容性复合体 多态性 抗病力
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 页码范围: 1293-1301
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17488

摘要

利用一对特异性引物DABF和DABR,分别从21尾感病和16尾抗病“全红”体色瓯江彩鲤的cDNA中,扩增出长度为624 bp的MHC-DAB基因片段.共测序185个有效克隆,获得76个不同的核苷酸序列.MHC-DAB基因片段包括第1～4外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区.长度为276 bp的β1结构域有144个核苷酸变异位点(52.17％)和70个氨基酸变异位点(76.07％),而长度为282 bp的β2结构域只有98个核苷酸变异位点(34.75％)和50个氨基酸变异位点(53.19％),显示β1结构域的变异要明显大于β2结构域.在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有23个发生了变异.β1结构域的PBR、非抗原结合位点( non-PBR)及β2结构域的ω值(ω=dN/ds)分别为1.367、0.886和0.754,表明“全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因(特别是β1结构域)在进化过程中受到正向选择作用.在所得的20个不同的等位基因中,基因DAB3*15在抗病群体中出现的频率(13.75％)显著高于感病群体中出现的频率(3.81％)(P＜0.05)；基因DAB3*09和DAB3*10的出现频率都为3.75％(P＜0.05),仅存在于抗病群体中；而基因DAB3*02和DAB3*14的出现频率分别为7.62％ (P ＜0.05)和8.57％(P＜0.01),仅存在于感病群体中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李雪松	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	5	53	4.0	5.0
2	刘至治	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
3	冯维	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	26	2.0	2.0
4	赵雪锦	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	32	2.0	2.0
5	马晓茜	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	48	2.0	2.0