菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析

• 作者: 张志想 李世访 潘嵩 王红清 葛蓓孛 赵哲
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菊花 菊花矮化类病毒 斑点杂交 RT-PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 观赏植物
• 页码范围: 2349-2356
• 分类号: S682.11
• 语种: 中文

摘要

菊花矮化病由菊花矮化类病毒（Chrysanthemum stunt viroid,CSVd）引起。从北京、海南万宁、合肥和哈尔滨共采集了122个野生及商业种植的菊花样品,使用改进的CTAB法提取菊花总RNA后,通过斑点杂交检测CSVd,应用RT-PCR对阳性样品进行克隆、测序。斑点杂交结果表明,在检测的122个样品中有14个样品感染了CSVd,感染率为11.5%;除哈尔滨外的其余3个地区均有CSVd的发生。序列比较分析结果表明,中国的CSVd分离物与韩国和日本分离物的序列最为接近,对其二级结构进行分析发现,与CSVd的参考序列（NC002015）相比,所获得的中国CSVd分离物的序列中虽然有21个碱基发生了突变（大多位于二级结构上的致病区内）,但并未影响其折叠成稳定的拟棒状结构。