一株H4亚型禽流感病毒全基因组序列测定及遗传演化分析

• 作者: 刘丽玲 刘娣 华育平 张翼 施建忠 曾显营 李雁冰 段振华 田国彬 陈化兰
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禽流感病毒 H4亚型 遗传演化分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 185-188
• 分类号: S852.65
• 字数: 2746字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2011.03.05

摘要

2008年对我国南方活禽市场进行流行病学监测时从鸭体内分离鉴定一株H4亚型禽流感病毒(AIV),命名为A/duck/Guangxi/912/2008(H4N2)(缩写为DK/GX/912/08).为了解该株H4亚型AIV的来源、特征及其分子演化规律,本研究对其全基因序列进行测定,并与GenBank登录的相关病毒进行遗传演化分析.结果表明:DK/GX/912/08 HA基因切割住点附近的氨基酸序列(PEKASR ↓ GLF)符合低致病力AIV的特征,其分子遗传演化关系属于东半球谱系的欧亚分支;NA基因与A/duck/Jiangxi/1286/2005(H5N2)在同一分支内,核苷酸同源性为98.1%;PB2基因与A/duck/Nanchang/4-165/2000(H4N6)处于同一分支;而NS基因与A/duck/Jiangxi/1786/03(H7N7)同源性最高.因此,推测DK/GX/912/08可能是不同来源的基因在鸭体内经过复杂重组演变的一株重组病毒.