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摘要:
目的 克隆并测定嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统部分编码基因GspF和Gsp E的完整基因序列.方法 分别根据已获得的嗜麦芽寡养单胞菌D2株部分序列.以及GenBank收录的K279a和R551株的序列依次设计3组引物,移步法PCR扩增GspF和E基因,产物纯化后连接pMD18T载体,经EcoRI和Hind Ⅲ双酶切鉴定后进行测序分析.将获得各PCR片段进行拼接.最终获得GspF和E基因的完整编码基因.并在GenBank中进行对比分析.结果 PCR先后扩增获得的3段序列,测序并拼接后发现其含有两个完整开放读码框架,分别为长1200 bp的GspF基因(GenBank收录号为GU377212.1)和长1 434 bp的GspE基因(GenBank收录号为HM151387).在GenBank中BLAST分析发现,D2株与嗜麦芽寡养单胞菌R551-3菌株的GspF基因及氨基酸序列同源性分别为93%和98%;GspE基因及氨基酸序列同源性与同菌种菌分别为92%和99%.结论 成功克隆出嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统基因簇中的GspF和GspE完整编码序列;嗜麦芽寡养单胞菌GspF和GspE种内高度保守,而其他细菌差异显著,提示其Ⅱ型分泌机制可能与其他革兰阴性菌有一定差异.
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文献信息
篇名 嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统下F和E基因序列测定
来源期刊 青岛大学医学院学报 学科 医学
关键词 嗜麦芽寡养单胞菌 Ⅱ型分泌系统 转膜蛋白 序列分析
年,卷(期) 2011,(1) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 1-4
页数 分类号 R446.51
字数 3013字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 闫志勇 青岛大学医学院微生物学教研室 111 476 11.0 16.0
2 胡明 青岛大学医学院微生物学教研室 21 19 3.0 4.0
3 杨丽 青岛大学医学院微生物学教研室 16 33 4.0 5.0
4 辛晓妮 青岛大学医学院微生物学教研室 7 25 3.0 4.0
5 罗玮 青岛大学医学院微生物学教研室 6 17 2.0 4.0
6 侯云 青岛大学医学院微生物学教研室 3 1 1.0 1.0
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Ⅱ型分泌系统
转膜蛋白
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37-1356/R
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24-126
1957
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