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嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统下F和E基因序列测定
嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统下F和E基因序列测定
作者:
侯云
杨丽
罗玮
胡明
辛晓妮
闫志勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
嗜麦芽寡养单胞菌
Ⅱ型分泌系统
转膜蛋白
序列分析
摘要:
目的 克隆并测定嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统部分编码基因GspF和Gsp E的完整基因序列.方法 分别根据已获得的嗜麦芽寡养单胞菌D2株部分序列.以及GenBank收录的K279a和R551株的序列依次设计3组引物,移步法PCR扩增GspF和E基因,产物纯化后连接pMD18T载体,经EcoRI和Hind Ⅲ双酶切鉴定后进行测序分析.将获得各PCR片段进行拼接.最终获得GspF和E基因的完整编码基因.并在GenBank中进行对比分析.结果 PCR先后扩增获得的3段序列,测序并拼接后发现其含有两个完整开放读码框架,分别为长1200 bp的GspF基因(GenBank收录号为GU377212.1)和长1 434 bp的GspE基因(GenBank收录号为HM151387).在GenBank中BLAST分析发现,D2株与嗜麦芽寡养单胞菌R551-3菌株的GspF基因及氨基酸序列同源性分别为93%和98%;GspE基因及氨基酸序列同源性与同菌种菌分别为92%和99%.结论 成功克隆出嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统基因簇中的GspF和GspE完整编码序列;嗜麦芽寡养单胞菌GspF和GspE种内高度保守,而其他细菌差异显著,提示其Ⅱ型分泌机制可能与其他革兰阴性菌有一定差异.
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文献信息
篇名
嗜麦芽寡养单胞菌D2株Ⅱ型分泌系统下F和E基因序列测定
来源期刊
青岛大学医学院学报
学科
医学
关键词
嗜麦芽寡养单胞菌
Ⅱ型分泌系统
转膜蛋白
序列分析
年,卷(期)
2011,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1-4
页数
分类号
R446.51
字数
3013字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
闫志勇
青岛大学医学院微生物学教研室
111
476
11.0
16.0
2
胡明
青岛大学医学院微生物学教研室
21
19
3.0
4.0
3
杨丽
青岛大学医学院微生物学教研室
16
33
4.0
5.0
4
辛晓妮
青岛大学医学院微生物学教研室
7
25
3.0
4.0
5
罗玮
青岛大学医学院微生物学教研室
6
17
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侯云
青岛大学医学院微生物学教研室
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2017(1)
引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
嗜麦芽寡养单胞菌
Ⅱ型分泌系统
转膜蛋白
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
青岛大学学报(医学版)
主办单位:
青岛大学医学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-4488
CN:
37-1356/R
开本:
大16开
出版地:
青岛市登州路38号
邮发代号:
24-126
创刊时间:
1957
语种:
chi
出版文献量(篇)
4762
总下载数(次)
6
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