MapReduce计算模型下的化合物LC-MS鉴定

• 作者: 刘勇 周园春 王卫华 薛兴亚 黎建辉
• 来源期刊: 计算机科学与探索
• 学科: 工学
• 关键词: MapReduce 色谱质谱联用(LC-MS) 化合物鉴定
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 学术研究
• 页码范围: 1094-1104
• 分类号: TP311
• 字数: 7121字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1673-9418.2011.12.004

摘要

随着质谱技术的迅猛发展,通过色谱质谱联用(liquid chromatography mass spectrometry,LC-MS)技术进行化合物鉴定成为近年来的研究热点.针对化合物LC-MS鉴定过程中便捷性和效率问题,提出了质谱谱图数据预处理方法,将包含两列数据的质谱文件转换成便于后续并行化处理的三列数据文件,简化了化合物相似度计算；同时结合MapReduce技术,对标准品库进行等价切分,提出了基于MapReduce计算模型的化合物LC-MS鉴定算法.实验结果表明,这种基于MapReduce的并行化方式可以大大提高化合物LC-MS 鉴定的效率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘勇	中国科学院计算机网络信息中心	211	1777	22.0	33.0
5	薛兴亚	中国科学院大连化学物理研究所生物技术部	37	558	13.0	22.0
6	周园春	中国科学院计算机网络信息中心	35	575	10.0	23.0
7	黎建辉	中国科学院计算机网络信息中心	60	630	16.0	24.0
8	王卫华	中国科学院计算机网络信息中心	4	30	3.0	4.0