应用Solexa技术检测脐血CD34+细胞体外诱导的巨核细胞mRNA表达

• 作者: 严力行 何吉 刘晋辉 吕行军 徐罡 朱发明 王芳 秦斐 陈舒
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 巨核细胞 mRNA表达 体外扩增 Solexa测序
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 529-532
• 分类号: R392.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.2011.05.010

摘要

目的 应用Solexa技术研究人脐带血CD34+细胞体外诱导巨核细胞的mRNA表达.方法 采用密度梯度离心法和免疫磁珠分选系统获取人脐带血CD34+细胞.100 ng/ml促血小板生成素诱导培养12 d后,应用抗CD41+单克隆抗体免疫磁珠法分选获得巨核细胞和非巨核细胞.应用Solexa技术检测巨核细胞和非巨核细胞的mRNA表达差异.结果 获取的Tag初始数量巨核细胞和非巨核细胞分别为3 773 147和3 533 805个.整个清晰的Tag数量分别为3 291 132和2 967 947个,明显独特的tag数量分别为197 769和245 318个.其中上调基因表达数量为1161个,下调为902个.上调Tag表达数量为2717个,下调为1519个.结论 巨核细胞和非巨核细胞mRNA表达存在显著差异,差异基因编码产物与细胞发育、黏附、凋亡、代谢、细胞内及细胞间的信号转导以及免疫应答等功能相关,进一步深入将有助于探讨巨核细胞的表达机制、信号传导及调控机制.