LMX1A基因多态性与中国汉族人群先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联

• 作者: 吴志宏 周熹 李想 王以朋 王海 费琦 邱贵兴
• 来源期刊: 中国组织工程研究与临床康复
• 学科: 医学
• 关键词: 先天性脊柱侧凸 病因 LMX1A基因 单核苷酸多态性 关联分析
• 年，卷（期）: 2011,（35）
• 所属期刊栏目: 临床实践
• 页码范围: 6632-6638
• 分类号: R318
• 字数: 6186字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-8225.2011.35.041

摘要

背景:先天性脊柱侧凸是由于胚胎期脊柱椎体发育异常引起的脊柱侧凸,其遗传病因学假说开始引起许多学者的重视.目的:通过候选基因LMX1A上关键单核苷酸多态性位点的筛查,探索LMX1A与中国汉族人群先天性脊柱侧凸及其不同临床表型之间的关联.方法:入选127例中国汉族先天性脊柱侧凸患者,另选取外伤、感染、炎症性疾病等患者127例为对照组.根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,应用Haploview 4.1软件选取LMX1A的标签和功能单核苷酸多态性位点.根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型.所有样本应用SNPstream UHT Genotyping系统对所选单核苷酸多态性位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组单核苷酸多态性位点间是否存在连锁不平衡.结果与结论:共筛选6个位点:SNP1(rs1819768)、SNP2(rs12023709)、SNP3(rs16841013)、SNP4(rs4656435)和SNP5(rs4657412)和SNP6(rs4657411),其基因型分布在病例组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;在基于基因型的关联分析中发现阳性位点SNP1和SNP2,单位点分析显示两位点基因型在病例组和对照组中的分布频率差异有显著性意义(P=0.026和P=0.026),在进一步非条件Logistic回归分析中发现这两个位点的基因型分布最符合Ressessive(OR=0.38;95%CI=0.15~0.94,P=0.029,AIC=354.9)遗传模型;SNP1、SNP2、SNP3和SNP6处于连锁不平衡状态,SNP4和SNP5也处于完全连锁不平衡状态,但单倍体型与先天性脊柱侧凸的发生风险之间不存在相关性;在进一步与先天性脊柱侧凸临床表型的关联分析中发现SNP1基因型AC型、SNP2基因型AG型、SNP3基因型CT型与有椎体形成障碍先天性脊柱侧凸的易感性升高有关.结果提示在中国汉族人群中LMX1A基因可能和先天性脊柱侧凸的发生、发展相关,是一个重要的易感基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邱贵兴	中国医学科学院北京协和医院骨科	131	1425	18.0	32.0
2	吴志宏	中国医学科学院北京协和医院骨科	54	597	11.0	23.0
3	王以朋	中国医学科学院北京协和医院骨科	68	458	10.0	18.0
4	费琦	首都医科大学附属北京友谊医院骨科	58	428	11.0	17.0
5	王海	中国医学科学院北京协和医院骨科	42	166	7.0	10.0
6	周熹	中国医学科学院北京协和医院骨科	12	54	5.0	6.0
7	李想	中国医学科学院北京协和医院骨科	6	21	3.0	4.0