稻瘟病菌几丁质结合蛋白的生物信息学分析

• 作者: 周洁 林雄杰 王宗华 鲁国东
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 生物信息学 稻瘟病菌 几丁质结合蛋白 EST
• 年，卷（期）: 2011,（21）
• 所属期刊栏目: 植物保护-研究报告
• 页码范围: 239-245
• 分类号: S435.111.41
• 字数: 3840字
• 语种: 中文

摘要

为了弄清稻瘟病菌数据库中可能的几丁质结合蛋白的分布及其结构特点,从而为进一步进行编码基因的功能研究打下良好基础.通过生物信息学技术对稻瘟病菌基因组中假定的几丁质结合蛋白的结构域、亚细胞定位及EST等进行分析,同时构建了系统发育树,并预测了这些蛋白在不同发育时期和不同组织中的表达特点.结果共得到了23个可能的几丁质结合蛋白,它们在7条染色体上的分布并不均匀；绝大多数的几丁质结合蛋白都定位在胞外.稻瘟病菌几丁质结合蛋白在不同发育时期和不同组织中的表达也各不相同；不同真菌间的几丁质结合蛋白相互交错,它们之间的进化关系十分复杂.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲁国东	福建农林大学植物保护学院	72	538	13.0	21.0
2	王宗华		74	760	17.0	25.0
3	周洁	福建农林大学生命科学学院	14	115	4.0	10.0
4	林雄杰	福建农林大学植物保护学院	4	15	2.0	3.0