复杂性疾病遗传研究中Tag SNP的筛选及其潜在功能预测

• 作者: 凌洁 朱益民 许玉洋
• 来源期刊: 浙江大学学报（医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 胰岛素样生长因子结合蛋白质类/遗传学 多态性,单核苷酸 转录因子 数据库,文献型
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 述评
• 页码范围: 237-244
• 分类号: Q78
• 字数: 5313字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9292.2011.03.002

摘要

利用公共数据库筛选与复杂性疾病相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP).运用FastSNP、SNP Function Prediction、F-SNP等多种SNP功能预测软件筛选有潜在功能的SNPs;通过HapMap等数据库筛选Tag SNP;综合比较各软件结果.以IGFBP 7基因为例,筛选转录因子结合位点SNPs 11个,内含子增强子31个,内含子增强子和转录因子结合位点4个,剪接位点1个,共47个SNPs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱益民	浙江大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学系	66	496	13.0	17.0
2	许玉洋	浙江大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学系	1	12	1.0	1.0
3	凌洁	浙江大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学系	2	35	2.0	2.0