斑翅草螽线粒体基因组序列测定与分析

• 作者: 周志军 尚娜 石福明 韦仕珍 黄原
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑翅草螽 线粒体基因组 序列分析 基因间隔序列 相对密码子使用频率
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 548-554
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

已经测定的昆虫线粒体基因组中,直翅目草螽亚科的疑钩额螽Ruspolia dubia线粒体控制区长度最短,仅70bp.为此,本研究采用L-PCR结合二次PCR扩增策略对另一种草螽亚科昆虫斑翅草螽Conocephalus maculates线粒体基因组序列进行了测定.序列注释发现:斑翅草螽线粒体基因组序列全长15 898 bp,A+T含量为72.05%,基因排列与典型的节肢动物线粒体基因组一致.全部蛋白质编码基因以典型的ATN作为起始密码子,9个蛋白质编码基因具有完整的终止密码子,其余4个以不完整的T作为终止信号.除trnSAGN外,其余21个tRNAs均可折叠形成典型的三叶草结构,依照Steinberg等(1997)线粒体特殊tRNA结构类型-9,trrnSAGN的DHU臂形成一个7 nt环,反密码子臂则长达9 bp,含1个突起碱基,而不是正常的5 bp.斑翅草螽与其他直翅目昆虫线粒体基因组的主要区别在于,在trnSUCN和nadl,nadl和trnLUN基因间各存在一段罕见的、大段的基因间隔序列,长度分别为78 bp和360 bp.其中,位于nadl和trnLCUN之间的基因间隔序列N链可形成一个包含完整起始、终止密码子(ATT/TAA)、编码103个氨基酸的未知开放阅读框.同义密码子使用偏好与线粒体基因组编码的tRNA反密码子匹配情况无关,但与密码子第3位点的碱基组成紧密相关;相对密码子使用频率(relative synonymous codon usage,RSCU)大于1的密码子,其第3位点全部是A或T.在已经测定的直翅目昆虫线粒体基因组tRNAs中,均存在一定数量的碱基错配,且以G-U弱配对为主,表明G-U配对在线粒体基因组中可能是一种正常的碱基配对形式.本研究测定的斑翅草螽线粒体基因组序列,和先前已经测定的直翅目线粒体基因组序列一起,可以为重建直翅目的进化历史提供数据资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石福明	河北大学生命科学学院	57	219	7.0	12.0
2	黄原	陕西师范大学生命科学学院	84	847	16.0	24.0
3	周志军	河北大学生命科学学院	4	25	2.0	4.0