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泉州市流感疫情实验室检测及H3N2亚型基因特性分析
泉州市流感疫情实验室检测及H3N2亚型基因特性分析
作者:
林锦忠
王耿
郑友限
陈明春
陈杰毅
龚彩婷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
流感,人
流感病毒A型,H3N2亚型
血凝素糖蛋白类,流感病毒
碱基序列
摘要:
目的 了解2009年泉州地区流感流行及病毒株的变异情况,探讨流感病毒基因的变异与流感流行的关系.方法 对泉州市198例流感患者的咽拭子采用MDCK细胞培养进行病毒分离,经血清学试验鉴定分型和实时荧光RT-PCR方法检测病毒核酸.对其中4株毒株提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,用DNAstar megalign软件分析基因.结果 198份咽拭子中有98份为H3N2亚型流感病毒核酸阳性,分离到62株H3N2亚型流感病毒,HA1基因经核苷酸序列测定显示,其基因特性更接近于A/Ningbo/333/2008,核苷酸同源性为98.7%,与A/Xiamen/70/2004的同源性为96.8%,由HA1基因核苷酸序列推导的氨基酸系列与疫苗株A/Brisbane/10/2007相比,有7个氨基酸位点发生变异,其中有1个位点位于抗原决定簇A区(144),有2个位点位于抗原决定簇B区(158、189),种系发生树分析也证实HA1基因存在一定差异.结论引起2009年泉州市流感在部分集体单位流行的病毒为H3N2亚型,其基因特性和抗原性与疫苗株相比均发生了一定变异.
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文献信息
篇名
泉州市流感疫情实验室检测及H3N2亚型基因特性分析
来源期刊
中华检验医学杂志
学科
医学
关键词
流感,人
流感病毒A型,H3N2亚型
血凝素糖蛋白类,流感病毒
碱基序列
年,卷(期)
2011,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
55-57
页数
分类号
R4
字数
2384字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2011.01.015
五维指标
作者信息
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姓名
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林锦忠
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流感,人
流感病毒A型,H3N2亚型
血凝素糖蛋白类,流感病毒
碱基序列
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华检验医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9158
CN:
11-4452/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-71
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
7229
总下载数(次)
38
总被引数(次)
76070
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