猪Toll样受体4基因(TLR4)外显子SNP检测及生物信息学分析

• 作者: 任守文 刘筱 方晓敏 李碧侠 王学敏
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 猪 Toll样受体4 SNP 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 782-789
• 分类号: Q78
• 字数: 4427字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2011.04.016

摘要

Toll样受体4(Toll-like receptor4,TLR4)是天然免疫系统识别病原微生物的主要受体,其多态性与动物对相关病原的免疫力有着明显的相关性.为了对猪TLR4基因进行多态性分析,试验采用PCR-SSCP结合核苷酸测序法研究了梅山猪、二花脸猪、苏钟猪、姜曲海猪、淮猪、金华猪、大约克猪、皮特兰猪及金华与皮特兰杂交F2代猪( JPF2)9个群体共90个样本TLR4基因外显子序列的单核苷酸多态性,并对猪TLR4基因进行了生物信息学分析.结果检测到4个突变:G400A、G962A、C1027A、G960A,其中前3个为有义突变,且C1027A突变引起编码氨基酸性质的改变；生物信息学分析表明猪TLR4基因含有一个2526 bp的开放阅读框,编码841个氨基酸；序列比较发现猪与牛、绵羊、人和小鼠TLR4基因cDNA序列相似性分别为87％、86％、79％、73％,编码的氨基酸序列相似性分别为81％、80％、73％、64％.TLR4基因多态性检测结果表明猪TLR4基因的单核苷酸多态性在中外猪种中存在明显差异,结合生物信息学分析推测该基因编码蛋白质LRR(富含亮氨酸重复序列)功能域上的突变可能与猪种对疾病的易感性不同有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李碧侠	江苏省农业科学院畜牧研究所	43	126	7.0	8.0
2	任守文	江苏省农业科学院畜牧研究所	58	191	7.0	10.0
3	王学敏	江苏省农业科学院畜牧研究所	38	117	7.0	8.0
4	方晓敏	江苏省农业科学院畜牧研究所	32	110	7.0	9.0
5	刘筱	江苏省农业科学院畜牧研究所	5	33	3.0	5.0