随机走步软聚类识别蛋白质网交叠功能模块

• 作者: 王希诚 王红
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质交互网 功能模块 随机走步
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 所属期刊栏目: 博士论坛
• 页码范围: 4-7
• 分类号: TP399
• 字数: 3894字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2011.09.002

摘要

认定蛋白质交互网中的功能模块对于理解细胞的组织结构,处理过程及其功能都是至关重要的.由于一个蛋白质可能具有多重功能因此蛋白质功能模块可能会相互交叠.然而,目前已有的一些识别功能模块的软聚类算法有如下两个缺陷:一是一些算法需要阈值来截断聚类;二是有些算法需要预设聚类数目.为了克服这两个缺陷,提出了随机走步软聚类识别算法来认定蛋白质交互网中的交叠功能模块.实验结果表明该算法在无需任何参数的情况下能发现一些重要的交叠功能模块.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王红	大连理工大学计算机科学与技术学院	8	38	3.0	6.0