缢蛏SRAP-PCR体系的正交优化

• 作者: 冯冰冰 刘达博 李家乐 林国文 钟玉民 陈慧
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 缢蛏 SRAP 正交设计 优化
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 99-103
• 分类号: S917.4
• 字数: 3434字
• 语种: 中文

摘要

运用L16(45)正交设计对影响缢蛏SRAP-PCR反应的5个因素:Taq酶浓度、Mg2+浓度、模板DNA浓度、dNTPs浓度和引物浓度在4个水平上进行了优化试验,PCR结果采用SPSS v16.0软件分析.结果表明,各因素对SRAP-PCR反应的影响依次为:引物>Taq酶>模板DNA>Mg2+;缢蛏SRAP反应最佳体系为:在20μL PCR反应体系中,引物0.3 μmol/L、Taq 酶0.5 U、模板DNA 50 ng、dNTPs 0.2 mmol/L及Mg2+2 mmol/L.用不同缢蛏的基因组DNA两次SRAP-PCR扩增,8对引物均能扩增出清晰且重复性好的谱带.因而建立的缢蛏反应体系稳定可靠.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林国文		18	175	8.0	12.0
2	陈慧		21	188	9.0	13.0
3	冯冰冰	上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	10	128	6.0	10.0
4	钟玉民	上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	4	33	3.0	4.0
5	刘达博	上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	6	78	5.0	6.0