军曹鱼线粒体DNA全序列与鲹鱼宗系的系统进化

• 作者: 刘楚吾 刘筠 王中铎 郭昱嵩
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 军曹鱼 线粒体DNA 系统进化 鲹鱼宗系
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 229-237
• 分类号: Q349
• 字数: 5241字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00229

摘要

通过长距PCR法测得军曹鱼(Rachycentron canadum)全长16758 bp的mtDNA基因组全序列(GenBank登录号:FJ154956和NC 011219),结构组成与其他硬骨鱼类基本一致.Blast获取GenBank数据库的高相似度(score=10055-30213)全序列数据,运用最大简约法、邻位连接法、最大似然法和贝叶斯法重建了军曹鱼与其他鱼类的系统发育关系,并采样用松散分子钟(Uncorrected relaxed lognormal clock)对军曹鱼的起源时间进行了估算,结果表明:(1)军曹鱼与鲯鳅科的亲缘关系较参与分析的其他鱼类更为密切(后验概率为0.997),推测军曹鱼大约起源于56百万年(Million years ago,Ma)前的古新世塔内特阶(Thanetian)时期;(2)军曹鱼科、鲯鳅科和印鱼科聚为一支,但其置信度较低(后验概率为0.593),且丝帆鱼科、鲹科分别与鲭科和鲀科鱼类聚为不同分支,因此不支持鲹鱼宗系(Carangoid lineage)为单系群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘楚吾	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	105	1315	18.0	30.0
3	刘筠	湖南师范大学生命科学学院	85	1970	25.0	42.0
4	郭昱嵩	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	34	378	9.0	18.0
5	王中铎	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	29	208	6.0	13.0