利用染色质免疫共沉淀技术确定转录因子RIN调控的靶基因

• 作者: 傅达奇 朱本忠 朱毅 李玲 田慧琴 罗云波
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 染色质免疫共沉淀技术 转录因子RIN LeACS2基因 LeACS4基因 番茄果实
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 166-170
• 分类号: Q943
• 字数: 3873字
• 语种: 中文

摘要

以粉红期番茄果实为材料,用含不同浓度甲醛的缓冲液交联DNA和蛋白质,利用超声波将其染色质随机断裂成大小为200-1 000 bp的片段,用RIN蛋白的特异性抗体免疫沉淀与RIN蛋白结合的DNA片段,然后解交联和纯化DNA片段,最终用普通PCR试验和测序验证与转录因子RIN结合的DNA序列.结果表明,适用于番茄果实的最佳ChIP试验条件为:用1％甲醛溶液交联DNA和蛋白质的复合物；用20％功率,工作6s,间隔10s,脉冲3次超声破碎该复合物,可以得到适当大小的片段,用于后续的试验.普通PCR和测序验证结果证明转录因子RIN与LeACS2和LeACS4启动子区域的CArG box序列结合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗云波	中国农业大学食品科学与营养工程学院食品生物技术实验室	257	3241	29.0	44.0
2	傅达奇	中国农业大学食品科学与营养工程学院食品生物技术实验室	23	168	9.0	12.0
3	朱本忠	中国农业大学食品科学与营养工程学院食品生物技术实验室	73	593	14.0	20.0
4	田慧琴	中国农业大学食品科学与营养工程学院食品生物技术实验室	34	320	10.0	17.0
5	朱毅	中国农业大学食品科学与营养工程学院食品生物技术实验室	121	371	9.0	18.0
6	李玲	天津农学院食品科学系	25	134	6.0	11.0