牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析

• 作者: 廖小林 张家波 张潇峮 徐亘博 陈松林
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 微卫星 FIASCO 多态性
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 页码范围: 961-968
• 分类号: Q958.1|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17330

摘要

将牙鲆基因组DNA经限制性内切酶RsaI和BstUI双酶切后采用FIASCO法构建酶切片段基因组文库.共挑取269个克隆,177个为阳性克隆,阳性克隆率为65.79%.经测序后获得191条微卫星序列,其中完美型占74.35%;非完美型占14.66%;混合型占10.99%.用引物设计软件Primer Premier5.0设计引物153对,挑选其中的50对合成并在32个野生牙鲆个体中进行扩增,共31个位点具有多态性,统计结果后使用POPGENE软件进行分析,平均等位基因个数为3.9394,平均有效等位基因数为3.0522,平均观测杂合度为0.6501,平均期望杂合度为0.5866,各引物的Hardy-Weinberg平衡指数在0.012587-0.984917变动.这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等工作中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张家波	华中农业大学水产学院	23	164	7.0	11.0
2	张潇峮	华中农业大学水产学院	6	15	3.0	3.0
6	徐亘博	中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室	1	6	1.0	1.0
7	廖小林	中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业可持续发展重点实验室	2	7	1.0	2.0