全基因组DNA甲基化芯片数据批次效应的评价

• 作者: 姚晨 李红东 郭政
• 来源期刊: 数理医药学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: TCGA 批次效应 甲基化芯片
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 142-144
• 分类号: R318.04
• 字数: 2087字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4337.2011.02.008

摘要

DNA甲基化芯片已广泛应用于癌症研究.但是有研究表明批次效应对基于高通量数据的研究有很大影响.癌症基因组计划 (TCGA)数据库包含大量的不同批次的高通量甲基化数据.通过分析TCGA中7种癌症的数据,发现批次效应在各种类型的癌症数据中都广泛存在,可能会导致错误的生物学分析结论.最后,建议用一个简单的方法来避免批次效应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭政	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	43	323	11.0	16.0
2	姚晨	电子科技大学生命学院生物信息中心和神经信息教育部重点实验室	2	4	1.0	2.0
3	李红东	电子科技大学生命学院生物信息中心和神经信息教育部重点实验室	3	8	2.0	2.0