多种芯片检测和多元分析法在肝纤维化患者血浆蛋白表达谱分析中的初步应用

• 作者: 刘杰 林成招 王吉耀 罗凯旋 陆晔
• 来源期刊: 环境与职业医学
• 学科: 医学
• 关键词: 表面增强激光解吸-离子化技术 血浆蛋白表达谱 生物信息学 肝纤维化
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 144-148
• 分类号: R135
• 语种: 中文

摘要

[目的]运用多种表面增强激光解吸.离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片及多元分析方法寻找由乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染引起的肝纤维化病程相关的血浆生物标志物.[方法]选用多种SELDI化学表面芯片,比较分析肝纤维化病人和正常血浆样本,筛选和确定3种最佳芯片类型.用这3种芯片分析无肝纤维化、轻度肝纤维化、重度肝纤维化和肝硬化4组共110例患者的血浆样本.运用主成分分析(PCA)、偏最小二乘回归(PLSR)、软独立建模分类法(SIMCA)等数据分析技术寻找差异蛋白.用聚类分析法研究差异蛋白的表达相似性.[结果]3种最适芯片类型分别是弱阳离子交换芯片(WCX2)、强阴离子交换芯片(SAX2)、固定化镍金属螯合亲和层析芯片(IMAC.Ni o这3种芯片吸附的蛋白质种类互不相同,所发现的差异蛋白质峰也不同.经t检验分析,3种芯片共发现了20个差异蛋白峰.运用PCA、PLSR、SIMCA等数据分析技术,分别发现了105、98、62个差异峰,并对差异峰的重要性的可信度进行衡量.运用聚类分析技术,将差异蛋白的表达模式分组.[结论]联用多种SELDI芯片检测,结合多元分析方法,使SELDI技术成为筛选疾病相关的生物学标志物的有力工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘杰	复旦大学附属中山医院消化内科	78	621	13.0	22.0
2	王吉耀	复旦大学附属中山医院消化内科	173	1473	19.0	28.0
3	陆晔	复旦大学化学系	53	771	13.0	27.0
9	林成招	复旦大学生物医学研究院系统生物学研究室	6	18	2.0	4.0
13	罗凯旋	复旦大学生物医学研究院系统生物学研究室	2	0	0.0	0.0