大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响

• 作者: 李小慧 李胜杰 杜芳芳 樊佳佳 白俊杰
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大口黑鲈 垂体特异性转录因子 单苷核酸多态性(SNPs) 关联分析
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 页码范围: 793-800
• 分类号: Q753|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17375

摘要

采用基因组步移技术克隆了大口黑妒垂体特异性转录因子POUlFl启动子序列,该序列全长1629by,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点.采用直接测序法研究发现,大口黑鲈POUlFl启动子序列的-18和-183两个位点存在SNPs,该两个突变位点只检测到A、B两种单倍型.对养殖群体进行不同单倍型的基因频率和生长关联分析,结果表明,单倍型A的等位基因频率为0.246,单倍型B的等位基因频率为0.754;群体关联分析表明,基因型为AA型和AB型的个体在体质量、体长、全长、体高和体宽等方面明显高于BB型个体,但基因型为AB型和AA型的个体之间在体质量方面没有明显差异.该研究结果为下一步进行分子标记辅助选择提供了基础.