紫云英SSR分子标记的开发及在品种鉴别中的应用

• 作者: 张辉 朱炳耀 林新坚 陈坚
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 紫云英 微卫星序列(SSR) 遗传多样性 链霉素亲和磁珠 品种鉴别
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1592-1596
• 分类号: S551.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.01592

摘要

利用生物素标记的(AG)15、(CT)1s、(AC)15、(GT)15探针及链霉素亲和磁珠,从紫云英的基因组中富集微卫星(SSR)序列.在用富集片段构建插入文库的950个转化子中,经PCR检测及测序共得到127个SSR序列,微卫星序列的富集效率达15.8％.除去重复或无效的序列,得到33个序列用于引物设计.对征集的9个紫云英品种进行多态性分析,有6对引物扩增出明显且稳定的多态性位点18个.在紫云英的品种水平上,这些SSR位点产生的多态率为50％～100％,有效等位基因数为1.19～1.64,Nei氏遗传多样性为0.13～0.38,Shannon多态信息指数为0.22～0.56;利用这6对引物可将参试品种完全区分开,证明这些SSR位点可用于紫云英品种的指纹鉴别.根据SSR位点的相似性系数,将9个紫云英品种主要聚成两个类群,与传统按生育期的紫云英品种划分结果无必然的联系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈坚	福建省农业科学院生物技术研究所	36	255	9.0	14.0
2	林新坚	福建省农业科学院土壤肥料研究所	186	2041	26.0	33.0
3	张辉	福建省农业科学院土壤肥料研究所	53	432	12.0	17.0
4	朱炳耀	福建省农业科学院生物技术研究所	18	65	6.0	7.0