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杜梨CPI基因的克隆、序列分析及表达
杜梨CPI基因的克隆、序列分析及表达
作者:
丛郁
常有宏
李慧
盛宝龙
蔺经
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
杜梨
半胱氨酸蛋白酶抑制剂
基因克隆
序列分析
表达特性
摘要:
植物半胱氨酸蛋白酶抑制剂(Cysteine proteinase inhibitor,CPI)在植物的抗逆基因工程中发挥着越来越重要的作用,分离和克隆植物CPI基因进而研究该基因的功能是植物抗逆基因工程研究的热点.为从分子水平上揭示CPI基因在杜梨防御机制中所起的作用,利用RACE和PCR方法,从杜梨种子中克隆CPI基因的cDNA和DNA序列,并采用跨内含子表达引物进行半定量RT-PCR来分析该基因在不同胁迫条件下的表达情况.结果表明:PbCPI基因cDNA长度为987 bp,开放阅读框包含738个核苷酸,编码1个由信号肽(26个氨基酸)和成熟肽(219个氨基酸)组成的多肽.该多肽预测的等电点为6.68,估计的相对分子质量为27 190.其对应基因组DNA序列由3个外显子(1 ~302 bp,401 ~772 bp,1615~1 897 bp)和2个内含子(303~400 bp,773~1 614 bp)组成.通过PSORT进行亚细胞定位分析发现PbCPI蛋白位于内质网上.PbCPI基因编码的多肽具有植物CPI产生抑制活性所必需的一级结构:2个甘氨酸残基( Gly46-Gly47)、假定的反应域QXVXG(Q90 -V91 -V92 -A93 -G94)和A/PW基序(p120-w121);并包含植物CPI家族高度保守的特征序列模式LARFAVQEHN、QVVAG和YQAKVWVKPW.进化树分析表明PbCP1和蔷薇科植物CPI蛋白位于分子进化树的同一发育分支上,并且与苹果MdCPI(AAO19652)蛋白具有较高的一致性(95.92%).杜梨叶片中PbCPI为诱导型表达,高温(30℃)、低温(4℃)、NaCl、机械损伤、MeJA或ABA处理4h后其表达量明显上调,即其对温度胁迫、盐碱、机械损伤和外源激素处理均存在转录响应,这表明该基因参与了杜梨对生物或非生物胁迫的防御机制.
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白羽鹌鹑
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克隆
原核表达
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
杜梨CPI基因的克隆、序列分析及表达
来源期刊
江苏农业学报
学科
生物学
关键词
杜梨
半胱氨酸蛋白酶抑制剂
基因克隆
序列分析
表达特性
年,卷(期)
2011,(5)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
1070-1077
页数
分类号
Q78
字数
4379字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-4440.2011.05.028
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
蔺经
江苏省农业科学院园艺研究所
149
1489
20.0
30.0
2
盛宝龙
江苏省农业科学院园艺研究所
95
1156
19.0
29.0
3
常有宏
江苏省农业科学院园艺研究所
130
1275
19.0
28.0
4
李慧
江苏省农业科学院园艺研究所
26
184
8.0
12.0
5
丛郁
中国科学院南京土壤研究所
10
90
5.0
9.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(21)
节点文献
引证文献
(9)
同被引文献
(22)
二级引证文献
(6)
1992(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1997(1)
参考文献(1)
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二级参考文献(0)
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参考文献(4)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2012(3)
引证文献(3)
二级引证文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
2015(1)
引证文献(1)
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2019(5)
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2020(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
杜梨
半胱氨酸蛋白酶抑制剂
基因克隆
序列分析
表达特性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏农业学报
主办单位:
江苏省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-4440
CN:
32-1213/S
开本:
大16开
出版地:
南京市孝陵卫钟灵街50号省农科院内
邮发代号:
28-113
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
3989
总下载数(次)
8
总被引数(次)
36498
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