肠道病毒71型安徽、河南株的分离与VP1序列进化分析

• 作者: 于翔 冯真真 杨全中 苏志国 邵强
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 基因型 手足口病 同源性 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 150-154
• 分类号: R5
• 字数: 3097字
• 语种: 中文

摘要

旨在研究手足口病患者中肠道病毒71型分离株的病毒基因型特征.采集手足口病患者的龚便标本,进行病毒分离和逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)特异性扩增进行鉴定,同时选取其中9株EV71分离株,对其抗原决定簇部位VPl区进行核酸序列测定,并参考EV71 A、B、C各基因型的参考株和以往中国EV71的分离株进行同源分析和构建系统发生树.结果显示,所分析的9株病毒株均为C4亚型,3株安徽株H7、H8和 H9的VPl序列相似度很高(≥98.8%,其中H7、H9的相似度为100.0%),4株河南株H3、144、H5和H6相似度较高(≥98.4%、F13、H4和H5≥99.6%,其中H3、H4的相似度为100.0%),它们同河南株H1、H5的相似度也较高(≥97.2%),河南株H2虽然与其他河南株具有较高的序列相似度,但进化分析表明,其与安徽株同源性较高.结果表明,安徽株H7、H8和H9株变异速率明显加快,这可能导致了手足口病在安徽省的率先爆发与大流行,河南株H2最初可能由安徽传入河南.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵强	河南师范大学生命科学学院	35	281	10.0	15.0
2	苏志国	中国科学院过程工程研究所	155	1885	23.0	35.0
3	杨全中	河南师范大学生命科学学院	2	7	2.0	2.0
4	于翔		2	4	1.0	2.0
5	冯真真	河南师范大学生命科学学院	2	6	2.0	2.0