大豆SBP转录因子家族的预测分析

• 作者: 刘春燕 刘洋 吴琼 徐晶 朱命喜 胡国华 陈庆山
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: SBP家族 转录因子 大豆
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 177-183
• 分类号: S565.1
• 字数: 4167字
• 语种: 中文

摘要

SBP 转录因子基因家族是一个植物的特异转录因子家族,SBP基因都含有一段保守的核苷酸序列即DNA结合结构域,又称为SBP盒(SBP-box),SBP盒编码的蛋白质序列称SBP结构域(SBP-domain),含79个氨基酸残基,并具有高度保守性.该研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与大豆基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准,共得到44条新的大豆SBP转录因子;又通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现这些转录因子参与生长发育、逆境胁迫响应、激素应答、抗霉菌应答、光合作用等调控过程.