牡丹SCoT分子标记正交优化及引物筛选

• 作者: 侯娟 侯小改 张钰乾 李嘉珏 王娟 贾甜
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牡丹 SCoT-PCR 反应体系 正交设计 引物筛选
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 页码范围: 92-96
• 分类号: S567.03
• 字数: 3537字
• 语种: 中文

摘要

以牡丹基因组DNA为模板,采用L16(45)正交试验设计对影响目标起始密码子多态性-聚合酶链式反应( SCoT-PCR)的五因素(Taq酶用量、Mg2+浓度、模板DNA用量、dNTPs浓度和引物浓度)进行优化试验,建立了优化的牡丹SCoT-PCR反应体系:Mg2+ 2.50 mmol/L、dNTPs 0.25 mmol/L、引物0.60 μmol/L、Taq DNA聚合酶0.50 U、模板DNA 1.00 ng/μL,1×PCR-Buffer,总体积20.00 μL.比较各因素对扩增反应的结果,其中以Mg2+浓度的影响最大,DNA模板用量的影响最小.运用牡丹17个品种验证了该体系稳定可靠,并从36个SCoT引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的24个引物.这一体系的建立及多态性引物的筛选为今后利用SCoT标记技术对牡丹进行相关研究提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯小改	河南科技大学农学院	99	893	17.0	26.0
2	王娟	河南科技大学农学院	78	313	9.0	15.0
3	贾甜	河南科技大学农学院	13	92	5.0	9.0
4	张钰乾	河南科技大学林学院	1	61	1.0	1.0
5	侯娟	河南科技大学林学院	1	61	1.0	1.0