罗非鱼源无乳链球菌cpsE基因的克隆和分子特性分析

• 作者: 付希 汪开毓 王均 王浩丞 肖丹 黄锦炉
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 无乳链球菌 cpsE基因 克隆 分子特性
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 页码范围: 660-667
• 分类号: Q786|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17332

摘要

利用特异性引物,采用PCR扩增出分离自患病罗非鱼无乳链球菌强毒株的cpsE基因,将其克隆到pMDl9-T载体上,通过菌落PCR鉴定和利用限制性内切酶BamH I和HindⅢ对重组质粒进行双酶切鉴定之后送测序公司测序,并利用生物信息学软件Clustal X 2.0、MEGA 4.1、Bioedit 7.0、TMHMM、NetPhos 2.0、NetNGlyc 1.0、SignalP 3.0 Server、PSIpred、SAM_T08以及CUSP等分析cpsE基因的分子特性.结果显示,罗非鱼源无乳链球菌cpsE编码氨基酸序列具有高度保守性,与人源、动物源无乳链球菌亲缘性达100%,具有1个参与催化糖基元转运的Glycosyltransferases超级家族结构域,具有与蛋白翻译后修饰功能相关的磷酸化位点3个,编码多肽链中亲水区大于疏水区,且存在跨膜区.密码子偏爱性分析表明,罗非鱼源无乳链球菌cpsE基因密码子使用频率差异较大,密码子偏爱性更接近真核生物.